PHP CLI 被系统级 timeout 杀掉需同步调整 max_execution_time（-d 参数）、ulimit -t 和 WSL systemd 的 DefaultLimitCPU；数据库中断则需设置 SESSION wait_timeout 或手动重连，flush()/set_time_limit() 在 CLI 下无效。
PHPStorm 运行长脚本时连接中断，不是 PHPStorm 的锅，而是 CLI 环境 + 数据库连接两层被系统或服务主动掐断。必须分清楚：脚本卡住是 PHP 被 kill，还是数据库报 MySQL server has gone away —— 两者原因和解法完全不同。
PHP CLI 被系统级 timeout 杀掉怎么办
PHPStorm 只是调用你配置的 PHP 解释器，它本身不设超时。真正动手的是系统对 CPU 时间的限制（ulimit -t）、WSL systemd 的 DefaultLimitCPU、或者 PHP 自身的 max_execution_time。
- 先在终端直接运行：
php your_script.php，如果也卡住或退出码为 -1，问题不在 PHPStorm - 在 PHPStorm 的 Run Configuration → Interpreter options 里加：
-d max_execution_time=0（注意：CLI 模式下ini_set('max_execution_time', 0)不生效） - WSL2 用户务必检查：
systemctl show --property=DefaultLimitCPU；若返回DefaultLimitCPU=300，说明 5 分钟就被杀，需改/etc/systemd/logind.conf中的UserTasksMax=infinity并重启systemd-logind - 临时绕过：在 PHPStorm Terminal 里先执行
ulimit -t unlimited，再跑脚本（仅对该 Terminal 会话有效）
数据库连接中途断开（MySQL server has gone away）
常发生在脚本执行几十秒后首次查询失败，错误信息明确包含 server has gone away 或 Connection reset by peer。根本原因是 MySQL 的 wait_timeout（默认 8 小时）虽长，但 CLI 脚本往往长时间没发任何 SQL，连接在服务端被回收；而 PHP 的 PDO/MySQLi 实例并不自动重连。
- 启动时显式设置会话级超时：
$pdo->exec("SET SESSION wait_timeout = 28800");（单位秒，建议 ≤ 28800） - 不要依赖
mysql.connect_timeout或default_socket_timeout—— 它们管的是“建连阶段”，不是“空闲保活” - 更稳妥的做法是在每次关键查询前做连接检测：
if (!$pdo->getAttribute(PDO::ATTR_CONNECTION_STATUS)) { $pdo = new PDO($dsn, $user, $pass); }，或封装一个reconnectIfClosed()辅助方法 - Laravel 等框架自带重连逻辑，但原生 PDO 不会自动重试，异常捕获后必须手动重建连接
为什么 flush() / echo / set_time_limit(0) 都没用
这些操作只影响 PHP 层或 HTTP 响应流，在 CLI 模式下 flush() 无意义；set_time_limit(0) 在 CLI 下默认就无效（除非 php.ini 显式设了值）；而 echo 输出只是写到 stdout 缓冲区，并不会触发系统级保活机制。
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set_time_limit()在 CLI 下受 php.ini 的max_execution_time值压制，且不能在register_shutdown_function()里调用 -
ignore_user_abort(true)对 CLI 脚本完全无效——它只在 Web SAPI 下有意义（客户端关浏览器后继续跑） - 别指望输出点文字就能“骗过” systemd 或 MySQL —— 它们看的是进程状态和网络包，不是 stdout 内容
最易被忽略的一点：WSL2 + Ubuntu 22.04+ 默认启用 systemd user session，DefaultLimitCPU 是硬性熔断开关，哪怕你把 PHP 和 MySQL 所有超时都设成 0，它照样在 5 分钟整准时 kill 进程，且不写任何日志。遇到“运行到 300 秒必挂”，第一反应不该是查 PHP 配置，而是 systemctl show --property=DefaultLimitCPU。
