Notepad++ 不支持按文件名自动配对合并两个文件夹中的同名文件，其“合并文件”功能仅拼接已打开标签页内容，无文件夹对比、同步或逐行合并能力，需依赖外部工具实现真正同步。
Notepad++ 本身不支持“按文件名配对合并两个文件夹中同名文件”——它没有文件夹级对比、配对或同步能力，所有所谓“合并文件夹”的操作，都是用户手动干预后的变通结果。
Notepad++ 的“文件 → 合并文件”只认标签页，不认文件夹
这个功能只处理当前 Notepad++ 实例中「已打开且未关闭」的标签页，按从左到右顺序拼接内容，中间加一个空行。它完全不感知文件路径、文件夹结构或文件名是否相同。如果你有两个文件夹 A\config.txt 和 B\config.txt，Notepad++ 不会自动识别它们是“同名”，更不会把它们逐行合并或左右对照。
常见错误现象： - 把两个文件夹拖进 Notepad++，结果只是打开了所有文件（可能上百个），标签页混乱，根本无法控制哪两个该配对 - 误以为“合并文件”能像 Beyond Compare 那样做文件夹同步，结果发现输出只是乱序拼接
使用场景仅限于：你已人工确认好哪两个文件要配对（比如 A\log_001.txt 和 B\log_001.txt），并手动将它们先后打开、调好顺序、再点菜单合并。
想逐行合并两个同名文件（如 A.txt + B.txt → C.txt 每行拼接）？得靠外部工具
Notepad++ 没有内置函数实现“第1行A+第1行B，第2行A+第2行B……”这种横向拼接。你需要用其他方式生成目标内容，再用 Notepad++ 查看或微调：
- PowerShell 脚本（推荐，Windows 原生）：
paste -d "" (Get-Content A.txt) (Get-Content B.txt) | Set-Content C.txt
注意：paste在 PowerShell 中不可直接用，实际需写循环或用Join-String（PS 7.3+）；更稳写法是：$a = Get-Content A.txt; $b = Get-Content B.txt; for($i=0; $i -lt [Math]::Min($a.Length,$b.Length); $i++) { "$($a[$i])$($b[$i])" } | Set-Content C.txt - Python（最可控）：
with open('A.txt') as f1, open('B.txt') as f2: for line1, line2 in zip(f1, f2): print(line1.rstrip('\n\r') + line2.rstrip('\n\r'))可加编码声明、空行跳过、长度不等时补空等逻辑 - 别用 Notepad++ 自带列编辑模式硬凑：列编辑是视觉块选，不是按行索引合并，两文件行数不等时极易错位
两个文件夹里同名文件内容对比？Notepad++ 只能单对单
菜单「插件 → Compare」或第三方 Compare 插件，只支持「当前文档」vs「另一个已打开文档」。它不能扫描两个文件夹、自动找出同名文件、批量打开并逐对比较。
你必须：
- 先在资源管理器里找出同名文件对（比如用 cmd 的 fc /b A\*.txt B\*.txt 列出差异，但无图形）
- 再手动用 Notepad++ 打开其中一对（如 A\settings.json 和 B\settings.json）
- 点「插件 → Compare → Compare」——此时才真正开始对比
容易踩的坑： - 文件编码不一致（一个 UTF-8，一个 GBK）→ 对比结果全是红色差异，实际只是编码解析错误 - 行尾符不同（CRLF vs LF）→ 每行末尾都标为不同，干扰真实内容判断 - 插件未安装或禁用 → 菜单里根本看不到 Compare 选项
真正需要文件夹级同步？换工具，别硬扛
Notepad++ 是文本编辑器，不是同步/差异工具。如果你的诉求是：
- 找出两个文件夹中哪些文件名相同但内容不同
- 自动合并同名文件的差异（三路合并）
- 生成同步报告或增量 patch
那应该用 WinMerge、FreeFileSync、rsync（WSL）或 VS Code 的扩展（如 Compare Folders）。
Notepad++ 在这个链条里唯一合理的角色是：作为这些工具的「差异查看器」——比如 WinMerge 设置外部比较器指向 notepad++.exe -nosession -multiInst -l，双击差异行时用它打开高亮显示。但它自己不驱动流程。
最常被忽略的一点：文件夹同步的本质是路径匹配 + 内容比对 + 写入策略，这三层逻辑 Notepad++ 一概不参与。强行用它“模拟”，只会把时间花在重命名、排序、反复打开关闭上，而不是解决问题本身。
