FIMO HTML 默认不包含画板名称，因其输出逻辑未将 motif_id 映射为 DOM 属性，仅用无语义的自增 ID（如 fimo-plot-0）；需通过后处理（如 Python + BeautifulSoup）结合 TSV 表格注入 data-motif-id 属性。
FIMO 输出的 HTML 默认不包含画板名称，需要手动注入或通过参数控制。它生成的交互式热图本身只保留 motif 富集结果和序列位置信息，画板（即单个 motif 的可视化区域）在 HTML 中没有语义化标识，比如 data-board-name 或 id 属性对应原始 motif ID。
为什么 HTML 里找不到画板名称？
FIMO 的 HTML 输出逻辑聚焦于渲染 SVG 热图和统计表格，不把 motif_id 或 track_name 映射为 DOM 元素的可读属性。所有画板（每个 motif 一个）都用类似 svg#fimo-plot-0、svg#fimo-plot-1 这样的自增 ID，无业务含义。
- 原始输入中 motif 名称来自
MEME或MAST格式文件的ALPHABET/MOTIF块，但 FIMO 不将其透传到 HTML - HTML 中的标题文字（如 “Motif 1”）是硬编码字符串，不是从输入 motif ID 衍生而来
- 若使用
--max-stored-scores或--verbosity参数，也不会影响 HTML 的 DOM 结构
如何让 HTML 包含可识别的画板名称？
唯一可靠方式是后处理生成的 HTML：解析 DOM，定位每个 svg#fimo-plot-N 元素，再根据 FIMO 输出的 TSV/HTML 表格中第 N 行对应的 motif_id 注入属性或标题。
- 用 Python +
BeautifulSoup读取fimo.html，提取table#fimo-table中每行的td:nth-child(1)（即 motif_id 列） - 遍历所有
svg[id^="fimo-plot-"]，按顺序匹配并添加data-motif-id属性，例如：svg.setAttribute("data-motif-id", "MA0001.1") - 也可在每个
svg前插入带名称的h3标签，便于人工浏览 - 注意：FIMO 的 HTML 表格行序与 SVG 画板序严格一致（从 0 开始），无需额外对齐逻辑
有没有命令行参数能直接输出带名称的 HTML？
没有。FIMO（v5.5.4 及之前）所有 HTML 相关选项（如 --html、--output-dir、--verbosity）都不支持自定义画板标识字段。
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--html只控制是否生成 HTML，不改变内容结构 -
--text输出纯文本 TSV，其中第一列就是motif_id，这是唯一带名称的官方输出 - 若需自动化集成，建议以 TSV 为主数据源，HTML 仅作可视化补充，用脚本桥接二者
真正容易被忽略的是：FIMO 的 HTML 不是“可编程界面”，而是静态快照。哪怕你改了输入 motif 文件里的 ID，只要没重跑 FIMO，HTML 就不会更新——它的画板名称缺失不是 bug，是设计如此。想靠它做前端联动或批量解析，必须加一层解析/注入逻辑。
