如何使用 MPI 在节点之间高效地发送和接收二维数组?
通过 MPI 发送和接收 2D 数组
利用 MPI 进行并行处理可提供巨大的性能优势,特别是对于涉及大型矩阵的计算。在这种情况下,将矩阵拆分到多个节点可以显着优化流程。
实现边值共享
在提供的场景中,每个节点必须与它的邻居。使用 MPI 实现此目的的建议方案如下:
if (myrank == 0) { for (i = 0 to x) { for (y = 0 to y) { C++ CODE IMPLEMENTATION MPI_SEND(A[x][0], A[x][1], A[x][2], Destination= 1...) MPI_RECEIVE(B[0][0], B[0][1]......Sender = 1...) } } if (myrank == 1) { for (i = x+1 to xx) { for (y = 0 to y) { C++ CODE IMPLEMENTATION MPI_SEND(B[x][0], B[x][1], B[x][2], Destination= 0...) MPI_RECEIVE(A[0][0], A[0][1]......Sender = 1...) } } }
优化数组分配
为了简化内存管理和 MPI 通信,请考虑分配具有连续元素的数组而不是 C 的“多维数组”。这可以使用以下函数来实现:
int **alloc_2d_int(int rows, int cols) { int *data = (int *)malloc(rows*cols*sizeof(int)); int **array= (int **)malloc(rows*sizeof(int*)); for (int i=0; i<rows; i++) array[i] = &(data[cols*i]); return array; } int **A; A = alloc_2d_init(N,M);
MPI Send/Receive
一旦连续分配数组,发送和接收整个 N x M 数组就变得简单:
MPI_Send(&(A[0][0]), N*M, MPI_INT, destination, tag, MPI_COMM_WORLD);
障碍与阻塞发送/接收
MPI 提供多种通信功能,包括阻塞(例如 MPI_Send)和非阻塞(例如 MPI_Isend)。对于阻塞操作,屏障是不必要的,因为通信本质上是同步的。
其他 MPI 函数
除了 MPI_Send 和 MPI_Receive,还可以考虑使用 MPI_Sendrecv 进行更灵活的通信或像 MPI_Isend 和 MPI_Irecv 这样的非阻塞操作可以重叠通信和计算。
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